matplotlib.subplots创建过慢（超20秒）问题排查求助

我日常用Python和Matplotlib做大量数据科学后处理，最近碰到个怪事：两台配置完全一致的Ubuntu22.04机器（Python3.10.12），同一脚本在PC1运行正常，但PC2里plt.subplots()创建图形要25.9秒，PC1只需要0.8秒，后续绘图速度倒是正常。

已经试过这些排查手段：更换Matplotlib版本、检查pandas/numpy等依赖、切换后端（但没有其他可用后端），都没解决，求排查方向。

测试程序 #

import sys
print(f'python v{sys.version}')

import time
start = time.time()

import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
v = matplotlib._version.version

end = time.time()
print(f'matplotlib.v{v} imported in {end-start:.1f} sec')
print(f'    (from {matplotlib.__file__})')

start = time.time()
backend = matplotlib.rcParams["backend"]
end = time.time()
print(f'backend {backend} identified in {end-start:.1f} sec')

start = time.time()
fig, ax = plt.subplots()
end = time.time()
print(f'plt.subplots called in {end-start:.1f} sec')

plt.show()

PC1运行结果 #

python v3.10.12 (main, Jun 11 2023, 05:26:28) [GCC 11.4.0]
matplotlib.v3.6.2 imported in 0.4 sec
    (from /volatile/home/XXXX/.local/lib/python3.10/site-packages/matplotlib/__init__.py)
backend GTK4Agg identified in 2.4 sec
plt.subplots called in 0.8 sec

PC2运行结果 #

python v3.10.12 (main, Jun 11 2023, 05:26:28) [GCC 11.4.0]
matplotlib.v3.6.3 imported in 0.4 sec
    (from /volatile/home/XXXX/.local/lib/python3.10/site-packages/matplotlib/__init__.py)
backend GTK4Agg identified in 2.2 sec
plt.subplots called in 25.9 sec

• 检查GTK4系统依赖：对比两台机器的GTK4相关包版本（用dpkg -l | grep gtk），比如libgtk-4-1、libgtk-4-bin等，确保PC2的依赖完整且版本匹配。
• 测试无GUI后端：临时设置export MPLBACKEND=Agg后运行脚本，如果速度恢复，说明问题出在GTK4后端的GUI初始化环节。
• 检查X11显示服务：若远程连接PC2，确认DISPLAY环境变量正常，尝试在本地终端运行脚本，排除X11转发延迟问题。
• 监控系统资源：运行脚本时用top/htop查看PC2的CPU、内存、磁盘IO占用，排查是否有进程阻塞资源。
• 重置Matplotlib配置：删除PC2的~/.config/matplotlib/目录，恢复默认配置后测试。
• 优化字体加载：在脚本开头添加plt.rcParams['font.family'] = 'DejaVu Sans'，指定单一字体，排查字体扫描慢的问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者FredJ