运行地球系统模型（CESM）时遭遇MPI执行错误求助

这个错误并非案例只能在HPC集群运行，本地Ubuntu虚拟机完全可以运行该案例，问题大概率出在MPI配置或案例提交脚本的设置上，以下是具体排查和解决方向：

一、排查MPI库本身的有效性 #

• 确认本地MPI版本：执行mpiexec --version，查看输出的MPI类型（OpenMPI/MPICH等）和版本号。部分旧版OpenMPI对嵌套MPI调用的支持存在问题，容易触发"mpiexec does not support recursive calls"错误。
• 验证MPI基础功能：编译运行一个简单的MPI Hello World程序，确认MPI库能正常工作：

  # 编写hello.c示例代码
  # #include <mpi.h>
  # #include <stdio.h>
  # int main(int argc, char** argv) {
  #     MPI_Init(NULL, NULL);
  #     int rank;
  #     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
  #     printf("Hello world from rank %d\n", rank);
  #     MPI_Finalize();
  #     return 0;
  # }
  mpicc -o hello hello.c
  mpiexec -n 4 ./hello
  

  如果该测试能正常输出各进程信息，说明MPI库安装本身无核心问题，问题出在CESM案例的配置逻辑上。

二、调整CESM案例的配置与提交逻辑 #

• 匹配MPI库配置：打开案例目录下的env_run.xml，确认MPILIB参数与本地安装的MPI类型一致（例如本地装的是OpenMPI，就设置为<entry id="MPILIB" value="openmpi"/>）；同时检查NODES、NTASKS参数，不要超过虚拟机的CPU核心数。
• 避免递归MPI调用：CESM的case.submit脚本默认适配集群调度器（如Slurm），本地运行时可能会嵌套调用mpiexec。可以直接修改case.submit，跳过调度器逻辑，直接用mpiexec ./cesm.exe启动程序；或者调整env_batch.xml中的BATCH_SYSTEM参数为none，让脚本以本地模式运行。
• 解决PMIX存储错误：针对dstore_base.c第1709行的PMIX错误，可尝试设置环境变量绕过该问题：

  export PMIX_MCA_dstore=hash
  export PMIX_MCA_gds=hash
  

  设置后重新执行./case.submit。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Aatreyee