Windows环境下R中GDAL Error1及节点栈溢出问题求助

• 操作系统：Windows
• 使用st_transform转换栅格文件CRS后绘图，触发GDAL Error 1警告；将矢量要素转换为该栅格新CRS后，用ggplot绘制sf点数据时再次触发GDAL Error 1，错误提示PostgreSQL目录下的proj.db版本不兼容，存在多PROJ版本冲突，最终出现Error: node stack overflow错误。
• 已安装PostGIS、R、QGIS，R中PROJ包版本为0.4.0；尝试重装R、rgdal无效，R Studio和VS Code中均会出现该问题。
• 咨询：是否需要清理安装GDAL？若需要，如何在不卸载PostGIS的情况下操作？

1. 是否需要清理安装GDAL？ #

需要，但无需完全卸载现有GDAL，核心是让R优先调用兼容的PROJ/GDAL版本，规避和PostGIS自带版本的冲突。

2. 不卸载PostGIS的操作步骤 #

• 步骤1：确认R当前使用的GDAL/PROJ路径
  在R中运行以下命令，查看当前加载的GDAL和PROJ路径，确认是否指向PostgreSQL目录（如C:\Program Files\PostgreSQL\XX\bin）：

  library(sf)
  sf_extSoftVersion()
  

• 步骤2：安装独立的GDAL/PROJ包
  下载OSGeo4W的64位安装包，安装到非PostGIS的独立目录（比如C:\OSGeo4W64），安装时勾选gdal、proj、geos相关组件。

• 步骤3：调整系统环境变量优先级

  1. 打开Windows「环境变量」设置（右键此电脑→属性→高级系统设置→环境变量）。
  2. 在系统变量的Path中，将OSGeo4W的bin目录（如C:\OSGeo4W64\bin）移到PostgreSQL的bin目录之前。
  3. 添加两个新的系统变量：
     • PROJ_LIB：值设为C:\OSGeo4W64\share\proj（对应你的OSGeo4W安装路径）
     • GDAL_DATA：值设为C:\OSGeo4W64\share\gdal（对应你的OSGeo4W安装路径）

• 步骤4：重新安装R的地理相关包
  先卸载现有冲突包：

  remove.packages(c("sf", "rgdal", "proj"))
  

  重启R后重新安装，确保包链接到新的GDAL/PROJ：

  install.packages("sf")
  install.packages("rgdal")
  install.packages("proj")
  

  再次运行sf_extSoftVersion()确认路径已切换到OSGeo4W目录。

• 步骤5：验证问题是否解决
  重新执行之前的st_transform转换和ggplot绘图代码，检查GDAL错误与栈溢出问题是否消失。

额外注意事项 #

• 不要删除PostGIS自带的PROJ/GDAL，PostGIS依赖其运行，仅调整优先级让R使用独立版本即可。
• 若QGIS出现版本冲突，可修改QGIS快捷方式的「目标」字段，添加OSGeo4W环境变量，确保QGIS使用自身默认的GDAL版本（QGIS通常默认安装在OSGeo4W目录下，一般不会冲突）。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Banerjee Anirban