Linux Mint下R包~/R/与/usr/路径差异及r2u更新问题咨询

1. ~/R/与/usr/下R包的区别 #

• 权限与访问范围：/usr/下的包是系统级资源，所有用户均可访问，安装、更新需要sudo权限；~/R/下的包是当前用户专属，无需管理员权限，仅对该用户可见。
• 管理方式与版本节奏：/usr/下的包由apt管理，版本适配系统稳定性，更新速度慢；~/R/下的包由R自身命令（如install.packages()）管理，直接从CRAN或r2u拉取最新版本，更新更及时。
• 依赖适配：系统目录的包会适配Debian/Ubuntu系的系统依赖，用户目录的包则优先适配当前R版本的最新依赖要求。

2. 是否需担心双R包库，能否安全合并 #

• 无需过度担忧双库：R的.libPaths()会优先加载~/R/下的包，实际运行时会使用用户目录的新版本，系统目录的旧包不会干扰正常使用。
• 不建议合并：两者的包管理机制完全独立，强行合并（如将用户包移至系统目录）可能引发权限冲突、依赖断裂，破坏系统包管理的一致性，保持分离是更安全的方案。

3. 如何屏蔽更新管理器中的R包更新通知 #

有两种实用方法：

• 方法一：终端锁定包
  打开终端，运行命令锁定所有R相关的系统包：

  sudo apt-mark hold r-cran-*
  

  后续若需解锁更新，执行：

  sudo apt-mark unhold r-cran-*
  

• 方法二：更新管理器可视化设置
  1. 打开Mint更新管理器，切换到「软件包」标签页
  2. 搜索r-cran-前缀的所有包并选中
  3. 右键选中的包，选择「忽略更新」即可

内容的提问来源于stack exchange，提问作者542goweast