如何在R中从不同文件夹导入同名多文件并单独处理？

要实现每个Data文件夹内的file1.csv和file2.csv独立读取、独立分析，不需要合并同文件名的文件，可以按文件夹维度循环，而不是按文件名维度批量读取。以下是具体实现方法：

基础R实现步骤 #

1. 定位所有Data文件夹路径
   先获取主目录下的所有Data子文件夹路径，确保只处理目标文件夹：

   # 主路径
   main_path <- "C:\\User\\Files\\"
   
   # 获取一级子文件夹的完整路径，筛选出包含"Data"的文件夹
   data_folders <- list.dirs(path = main_path, recursive = FALSE, full.names = TRUE)
   data_folders <- grep("Data", data_folders, value = TRUE)
   

2. 循环读取每个文件夹内的两个CSV文件
   遍历每个Data文件夹，单独读取其中的file1.csv和file2.csv，可以直接在循环内做分析，也可以将数据存入列表方便后续调用：

   # 创建列表存储所有数据，结构为：文件夹名 → 包含file1、file2数据框的子列表
   all_data <- list()
   
   for (folder in data_folders) {
     # 拼接当前文件夹内的两个文件路径
     file1_path <- file.path(folder, "file1.csv")
     file2_path <- file.path(folder, "file2.csv")
     
     # 读取文件
     df_file1 <- read.csv(file1_path)
     df_file2 <- read.csv(file2_path)
     
     # --------------------------
     # 这里插入你的独立分析代码
     # 示例：打印当前文件夹的文件基本信息
     cat("=== 处理文件夹:", basename(folder), "===\n")
     cat("file1.csv 行数:", nrow(df_file1), "列数:", ncol(df_file1), "\n")
     cat("file2.csv 行数:", nrow(df_file2), "列数:", ncol(df_file2), "\n\n")
     # --------------------------
     
     # 将当前文件夹的数据存入列表
     all_data[[basename(folder)]] <- list(
       file1 = df_file1,
       file2 = df_file2
     )
   }
   

3. 调用独立数据
   循环结束后，可以通过列表索引直接调用任意文件夹的任意文件：

   # 查看Data1文件夹下的file1.csv数据
   head(all_data[["Data1"]][["file1"]])
   
   # 查看Data3文件夹下的file2.csv数据
   summary(all_data[["Data3"]][["file2"]])
   

为什么你的原有方法会合并文件？ #

你之前的代码只是批量收集了所有同名文件的路径，若后续用lapply(files1, read.csv) %>% bind_rows()这类操作，就会把所有file1.csv合并成一个数据框。而按文件夹循环的方式，会让每个文件夹内的两个文件始终保持独立，完全满足你"独立分析"的需求。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者starski