R Markdown knit报错：不存在的特殊字符异常（ggplot相关）

问题原因 #

代码直接运行正常但Knit报错，核心原因是你给代码块开启了tidy=TRUE自动整理功能。在代码格式化过程中，整理工具（如formatR）意外生成了无效的%符号，导致R解析代码时出错——直接运行代码不会触发这个整理步骤，所以不会出现问题。

解决方案 #

• 关闭当前代码块的自动整理：把代码块开头的参数改成{r tidy=FALSE}，彻底跳过整理步骤，避免格式化错误。
• 调整整理参数：如果需要保留自动整理，尝试修改width.cutoff的值（比如改成80），或者去掉tidy.opts选项，看是否能解决工具的异常格式化问题。
• 检查其他代码块：报错信息提到了unnamed-chunk-2和unnamed-chunk-3，也要确认这些块是否开启了tidy=TRUE，并排查是否有注释、换行等导致整理工具误判的情况。

修改后的代码块示例 #

{r tidy=FALSE}
all_2014 <- ggplot(bunc.SNAP_geq_Pov, aes(fill = percent_geq_pov)) + 
  geom_sf(color = "black", size = .5) +  
  theme_minimal() +
  scale_fill_viridis_c(option = "magma", direction = -1) + ggtitle("2014") +
  theme(plot.title = element_text(size = 8, face = "bold")) +
  # facet_wrap(~county) + 
  # Here, it will place them together to form the overall area but I can't delineate between county boundaries since this is on the tract level
  theme(
    panel.grid.major.x = element_blank(),  
    panel.grid.minor.x = element_blank(), 
    panel.grid.major.y = element_line(),   
    panel.grid.minor.y = element_blank(),  
    axis.text = element_text(angle = 30, vjust = 1, hjust = 0.8, size = 5),
    legend.position = "none" 
  )

内容的提问来源于stack exchange，提问作者amrungwaew