如何将编号基因文件分类复制到递增编号文件夹中

我有一批命名为gene_1.fa、gene_2.fa……gene_19500.fa的基因文件，需要将它们分类放入200、400、600……19600这些文件夹中用于下游分析。原本的实现思路需要写大量elif判断，操作十分繁琐：

for file in "${files[@]}"; do

    base_name=$(basename "$file")
    gene_number=$(echo "$base_name" | cut -d'_' -f2 | cut -d'.' -f1)
    to_path= (path to folder containing 200, 400, ... 19600 folders)
    
    #if it's gene_200.fa, 400.fa etc. copy into that dir
    if (( $gene_number%200 == 0)); then 
        cp file $to_path/$gene_number/$file
    elif (( $gene_number < 200 )); then 
        cp file $to_path/200/$file
    elif (( $gene_number > 19400)); then 
        cp file $to_path/19600/$file
    # the endless pain of 200-400, 400-600, 600-800 ... 19200-19400
    elif (( $gene_number > 200 && $gene_number < 400)); then 
        cp file $to_path/19600/$file
    elif ....

我需要更简便的实现方法，且确保单个文件不会被复制到多个文件夹中。

可以通过算术运算直接计算出每个文件对应的目标文件夹，避免大量条件判断，脚本如下：

# 替换为存放200、400等文件夹的根路径
to_path="/your/target/root/path"

# 遍历所有基因文件
for file in gene_*.fa; do
    # 提取文件名中的基因编号
    gene_number=$(echo "$file" | sed -E 's/gene_([0-9]+)\.fa/\1/')
    
    # 计算目标文件夹
    if (( gene_number <= 200 )); then
        target_dir="200"
    elif (( gene_number >= 19401 )); then
        target_dir="19600"
    else
        # 通过向上取整计算对应区间的文件夹名
        target_dir=$(( ((gene_number + 199) / 200) * 200 ))
    fi
    
    # 确保目标文件夹存在（不存在则自动创建）
    mkdir -p "$to_path/$target_dir"
    # 复制文件到目标文件夹
    cp "$file" "$to_path/$target_dir/"
done

关键说明 #

• 基因编号提取：用sed正则表达式一次性从文件名中提取数字，比多次cut更简洁高效。
• 目标文件夹计算：
  • 编号≤200直接归入200文件夹，编号≥19401直接归入19600文件夹；
  • 中间编号通过((gene_number + 199) / 200) * 200实现向上取整后乘以200，自动匹配对应的区间文件夹（比如201→400，401→600，以此类推）。
• 避免重复复制：每个文件只会根据编号计算出唯一的目标文件夹，不会出现一个文件被复制到多个文件夹的情况。
• 容错处理：mkdir -p确保目标文件夹存在，即使之前未创建也不会报错。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Amanda