Python3.6.8环境下pip安装hdbscan==0.8.26构建wheel失败求助

问题根源 #

hdbscan==0.8.26的Cython扩展编译对依赖版本有严格要求：新版本Cython与Python3.6的类型系统兼容性差，会触发类型转换错误；同时编译过程依赖numpy的头文件，缺失会导致找不到dist_metrics.pxd这类文件。

解决方案 #

• 步骤1：安装兼容版本的Cython
  Python3.6.8需搭配Cython==0.29.21（该版本能正确处理hdbscan的Cython代码，避免类型转换错误），执行命令：

  pip install Cython==0.29.21
  

• 步骤2：安装兼容版本的numpy
  编译hdbscan需要numpy的头文件支持，Python3.6对应的兼容版本为numpy==1.19.5，执行命令：

  pip install numpy==1.19.5
  

• 步骤3：配置VS Build Tools环境后安装hdbscan
  在批处理脚本中，先加载VS Build Tools的编译环境（根据你的VS版本调整路径，以下以VS2019 Build Tools为例），再执行pip安装：

  "C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio\2019\BuildTools\VC\Auxiliary\Build\vcvarsall.bat" x64
  pip install hdbscan==0.8.26
  

• 备选方案：使用预编译Wheel文件
  若编译仍失败，可直接下载对应Python3.6、Windows x64架构的hdbscan==0.8.26预编译wheel文件，本地安装：

  pip install path\to\hdbscan-0.8.26-cp36-cp36m-win_amd64.whl
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者DasmuR