ImageJ Macro中setOption无法阻止Save Changes提示问题求助

核心原因是你设置的setOption("Changes", false);被后续插件操作覆盖了：

• 你在运行Landmark Correspondences前重置了图像的修改标记，但该插件会直接修改当前打开的目标图像，操作完成后自动把图像的changes标记设回true，导致之前的重置完全失效。
• 循环结束后的批量关闭操作会检查所有打开的图像，被插件修改过的原始目标图像因为changes标记为true，所以触发保存提示。

以下两种方案都能解决这个问题，可根据需求选择：

方案一：关闭前重新重置修改标记 #

在每个循环迭代末尾，保存完变换后的图像后，针对当前目标图像重新重置changes标记再关闭，避免批量关闭时残留修改图像：

// Iterate through the list of Target images
for (i = 0; i < files.length; i++) {
    open(NewFolder + files[i]);
    Target_Image = getTitle();
    
    // Select the previously added ROI
    roiManager("Select", 0);
    
    // Use the `Transform -> Landmark Correspondence` plugin
    run("Landmark Correspondences", "source_image=Target_Image template_image=Reference_Image transformation_method=[Least Squares] alpha=1 mesh_resolution=32 transformation_class=Affine");
  
    // Save the transformed image in the "Registered_Images" folder
    title = getTitle();
    saveAs("tiff", NewFolder2+title);
    
    // 关键：重置当前图像的修改标记并关闭
    setOption("Changes", false);
    close();
}

// 循环内已处理完所有图像，直接关闭ROI管理器即可
close("ROI Manager");

方案二：直接无提示关闭图像 #

如果你确认不需要保留原始目标图像的修改，可以直接用close("no");命令跳过保存提示：

// Iterate through the list of Target images
for (i = 0; i < files.length; i++) {
    open(NewFolder + files[i]);
    Target_Image = getTitle();
    
    // Select the previously added ROI
    roiManager("Select", 0);
    
    // Use the `Transform -> Landmark Correspondence` plugin
    run("Landmark Correspondences", "source_image=Target_Image template_image=Reference_Image transformation_method=[Least Squares] alpha=1 mesh_resolution=32 transformation_class=Affine");
  
    // Save the transformed image in the "Registered_Images" folder
    title = getTitle();
    saveAs("tiff", NewFolder2+title);
    
    // 直接无提示关闭当前图像
    close("no");
}

close("ROI Manager");

• 无需在插件运行前设置setOption("Changes", false);，因为插件操作会直接覆盖这个标记，完全起不到作用。
• 方案一更严谨，明确标记图像为未修改状态；方案二更简洁，适合确认不需要保留原始修改的场景。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Gianluca