解析PDF时PyPDF2与fitz获取的坐标为何不一致？

我正在用Python解析一个尺寸为30000x2000点的PDF文件，文件里包含表格、线条、文本、注释、图片等各类数据，目标是定位特定文本并获取其附近的注释。我用PyPDF2获取所有注释及其坐标，用fitz（PyMuPDF）查找文本字符串及其坐标。通过fitz搜索'A715_X1'得到X坐标为9076点；通过PyPDF2搜索注释'Some text here'得到X坐标为4280点。但根据PDFXchange的截图，'A715_X1'位于'Some text here'注释正下方，二者X坐标应大致相同（误差仅几个点），且9076符合标尺显示的真实数值。请问为何会出现两组不同的坐标？

用到的代码 #

fitz（PyMuPDF）代码 #

import fitz    
doc = fitz.open(path_pdf)
for page in doc:
    coordinates_of_item_found_on_print = page.search_for('A715_X1')

PyPDF2代码 #

from PyPDF2 import PdfReader

reader = PdfReader("sample.pdf")
markup_loc = []
for page in reader.pages:
    if "/Annots" in page:
        for annot in page["/Annots"]:
            obj = annot.get_object()
            markup_coordinates = obj['/Rect']
            if obj['/Subtype'] == '/FreeText':  # 跳过Stamp、Popup、Square、PolyLine类型注释
                if obj['/Contents'] == 'Some text here':
                    try:
                        markup_loc.append(str(round(markup_coordinates[0])))
                        print('Note: ' + obj['/Contents'] + ' X-coord: ' + str(round(markup_coordinates[0])))
                    except Exception as e:
                        print(e)

• 坐标变换处理逻辑不同：fitz会自动应用页面的当前变换矩阵（CTM），返回的是经过旋转、缩放等调整后的用户空间坐标，以页面左下角为原点，和PDFXchange阅读器的标尺显示逻辑一致，所以9076是真实显示的坐标；而PyPDF2直接读取注释的/Rect原始字段，不会自动处理页面变换，得到的是未经过调整的原始坐标。
• 坐标系基准差异：PDF的注释/Rect字段基于文件内部的媒体盒或裁剪盒定义，而fitz返回的坐标是统一适配后的用户空间坐标，两者的基准不一致，导致数值偏差。
• 注释坐标的原始性：部分PDF中注释的坐标是基于局部坐标系定义的，fitz会自动将其转换为全局页面坐标，而PyPDF2只会读取原始存储的数值，不会做全局转换，这也是坐标不一致的原因之一。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Yurii Gul