ggplot2堆叠柱状图：柱内填充占比异常问题求助

问题根源 #

你当前的代码错误地将Total（总计值）作为y轴映射，而堆叠柱状图需要为每个Type（结构类型）分配对应的单独数值，而非用总计值。如果你的数据是宽格式（比如Genus列之外，每个Type是单独一列，Total是各类型的总和），ggplot无法识别每个类型的具体数量，只能把每个柱子按Type的数量均分高度，导致占比完全一致。

解决步骤 #

1. 转换数据格式
   把宽格式数据转成ggplot要求的长格式（每行对应一个Genus+Type的组合，记录该类型的数量），用tidyr::pivot_longer实现：

   library(tidyr)
   library(dplyr)
   
   # 排除Total列，将所有Type列转为长格式
   Brass.long <- Brass.ready %>%
     select(-Total) %>%
     pivot_longer(cols = -Genus, names_to = "Type", values_to = "Count")
   

2. 修正绘图代码
   用转换后的Count列作为y轴，而非原有的Total：

   ggplot(Brass.long, aes(x = Genus, y = Count, fill = Type)) +
     geom_col() +
     theme(axis.text.x = element_text(angle = 65, vjust = 0.75)) +
     labs(title = "Mycorrhizal Structures Across Genera",
          x = "Genus",
          y = "Total Fungal Structures")
   

补充说明 #

你提供的图表显示每个属对应的柱子内，不同结构类型的填充高度完全相同，这正是因为原代码没有为每个Type绑定对应的数值，ggplot只能默认均分柱子高度。转换数据格式后，每个类型的真实数量会被正确映射到y轴，堆叠高度就会和实际数据匹配。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sara S