R语言Circular包计算海龟孵化巢平均方向结果异常求助
海龟幼体定向数据圆形平均计算异常排查
我在处理濒危海龟孵化幼体的定向数据,需要为每个巢穴计算平均方向,但部分巢穴的计算结果存在异常(并非所有巢穴都有问题)。目前不确定问题出在以下哪个环节:
- Circular包的平均计算逻辑
- 按巢穴标签子集化数据的方式
- 绘图方向校正的
zero=pi/2参数
操作流程
- 从主数据表
circdata中提取方位数据创建circular对象cdata(因Circular包不支持主表中的非数值型数据) - 绘制目标巢穴的数据点
- 计算该巢穴的圆形平均方向并以箭头标注
代码片段
# 创建circular对象 cdata<- circular(circdata$Diff.360, type="directions", units="degrees", template="none",rotation = ("clock"),modulo = ("2pi") ,zero = pi/2) # 绘制目标巢穴A401的数据点 plot(cdata [circdata$Nest.Tag == "A401"], cex=0.9, bin=180, stack=TRUE, sep=0.07, shrink=1.5) # 计算并标注平均方向 df3mean<- mean.circular(cdata [circdata$Nest.Tag == "A401"], na.rm = TRUE) arrows.circular(df3mean,lwd = 3)
疑问点
通过主数据集circdata的巢穴标签对cdata进行子集化计算均值,这种方式是否会引发问题?
异常表现
图示中每个数据点代表一只幼体的定向,但Circular包计算出的圆形平均方向箭头与实际数据点位置明显不符。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者a.wright
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