R语言：如何提取列总和大于0的数据框列名？

首先要明确：你提供的对象是矩阵而非数据框，矩阵的列名不能用names()获取，得用colnames()。

正确代码 #

# 先查看各列总和
colSums(df)
#> SRR960396 SRR960402 SRR960403 
#>        14         0        13 

# 筛选列总和大于0的列名
colnames(df)[colSums(df) > 0]
#> [1] "SRR960396" "SRR960403"

之前方法出错的原因 #

• names(df)[colSums(df)>0] 返回NULL：矩阵没有names属性，只有colnames和rownames，所以names(df)本身就是NULL，后续索引自然也返回NULL。
• df[sapply(df, function(x) any(x > 0))] 返回数值而非列名：这段代码是筛选出至少有一个大于0值的列，但返回的是筛选后的子矩阵。如果要通过这个逻辑获取列名，可改成colnames(df)[sapply(df, function(x) any(x > 0))]，结果和上面一致。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Geomicro