首先明确说：手动删除.git/objects/pack/下的pack文件绝对不安全！这些pack文件是Git存储历史对象的核心文件，随意删除会直接破坏仓库结构，导致历史数据丢失，甚至整个仓库无法正常使用，千万不要这么做。

你遇到的情况是正常的——虽然git filter-branch已经从所有提交中移除了大文件，但Git默认会保留旧的对象一段时间（通常30天），作为安全回溯机制，防止你误操作后无法恢复数据。那些旧的包含大文件的对象还躺在pack文件里，所以仓库体积没变化。

正确的清理步骤如下：

• 首先确认你已经完成所有分支的历史修改，并且不再需要包含大文件的旧历史，然后执行：

  # 立刻清除所有引用的过期reflog，告诉Git旧对象不再被需要
  git reflog expire --expire=now --all
  # 执行彻底的垃圾回收，立刻删除无引用的对象并优化仓库
  git gc --prune=now --aggressive
  

• 执行完上面的命令后，再用du -hs .检查仓库大小，应该就能看到体积明显减小了。

额外补充几点：

1. 如果你已经把修改后的历史推送到远程仓库，需要执行git push --force来覆盖远程的旧历史（注意：这会改写远程仓库的历史，一定要提前和团队成员沟通，让他们同步更新本地仓库，避免冲突）。
2. 如果你使用的是Git 2.22及以上版本，更推荐用git filter-repo代替git filter-branch——后者已经被官方标记为过时，filter-repo更高效、更安全，处理大文件的速度也更快。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者T0maas