如何解决conda安装OpenMM时的IncompleteRead连接中断错误

• 切换国内conda镜像源
  官方conda-forge源在国内访问稳定性差，容易出现断连问题。可以替换为国内镜像源，操作如下：

  1. （可选）备份原有配置：conda config --show-sources > ~/.condarc.bak
  2. 添加清华镜像源：

     conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
     conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
     conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r/
     conda config --set show_channel_urls yes
     conda config --set channel_priority strict
     

  配置完成后重新执行安装命令。

• 增大conda远程读取超时时间
  网络波动时，默认超时时间过短会导致下载中断。执行以下命令将超时时间调至120秒（可根据实际网络情况调整）：
  conda config --set remote_read_timeout_secs 120
  调整后重试安装操作。

• 手动下载包后本地安装
  如果镜像源仍不稳定，直接到国内镜像站找到与你的系统、Python版本匹配的openmm和cudatoolkit包（格式为.tar.bz2），下载到本地后，通过本地路径执行安装：
  conda install /your/local/path/openmm-x.x.x.tar.bz2 /your/local/path/cudatoolkit-x.x.x.tar.bz2

• 清理conda缓存后重试
  缓存的损坏包可能引发下载异常，先清理所有缓存：
  conda clean --all
  清理完成后重新运行安装命令。

• 用mamba替代conda执行安装
  mamba是conda的高性能替代工具，下载速度更快、稳定性更强。先安装mamba：
  conda install -n base conda-forge::mamba
  再用mamba执行安装：
  mamba install -c conda-forge openmm cudatoolkit

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Hanjiahe