如何将矩阵data_me的行名转换为名为GENE_ID的新列？

你现在有一个matrix/array类型的对象data_me，行名是ENSG开头的标识符，想要把这些行名提取出来做成一个叫GENE_ID的新列对吧？我给你两个实用的方法，都是R里常用的操作：

方法一：Base R原生实现 #

不需要额外安装包，用基础R就能搞定：

# 1. 先把矩阵转换为data.frame（因为矩阵无法存储混合类型数据，必须转成data.frame才能加字符型的GENE_ID列）
data_df <- as.data.frame(data_me)

# 2. 将原矩阵的行名赋值给新列GENE_ID
data_df$GENE_ID <- rownames(data_me)

# 可选操作：把GENE_ID列移到第一列（如果需要调整列顺序的话）
data_df <- data_df[, c("GENE_ID", setdiff(colnames(data_df), "GENE_ID"))]

# 可选操作：重置行名（避免保留原矩阵的行名）
rownames(data_df) <- NULL

方法二：用dplyr包简化操作 #

如果你习惯用tidyverse系列工具，dplyr的语法会更简洁直观：

# 如果还没安装dplyr包，先执行安装：
# install.packages("dplyr")

library(dplyr)

data_df <- as.data.frame(data_me) %>%
  # 添加GENE_ID列，值为原矩阵的行名
  mutate(GENE_ID = rownames(data_me)) %>%
  # 把GENE_ID列移到所有列的最前面
  relocate(GENE_ID, .before = everything()) %>%
  # 重置行名，去掉原矩阵的行名
  rownames_to_column(NULL)

执行完任意一种方法后，data_df就是你想要的data.frame，其中GENE_ID列存储了原来的ENSG行名，其他列保留原矩阵的数值数据。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者YiHao Chen