移除并重新添加JAR依赖后Spring Boot应用启动异常求助

原JAR包结构（简化描述，实际为Spring Boot可执行JAR结构）：

project.jar
-- SUBFOLDER  
-- classes   
-- lib
     -- dependency1.jar
     -- dependency2.jar
     -- dependencyN.jar

执行任务：从主JAR包project.jar中移除dependency1.jar和dependency2.jar，之后再添加回原JAR包。移除后JAR可运行（部分功能不可用为正常情况），但重新添加后应用完全无法运行。

尝试过的操作：

• 使用jar工具执行命令：jar -uf project.jar dependency1.jar dependedncy2.jar
• 使用zip工具直接添加依赖JAR
• 解压依赖JAR，仅将类文件添加到project.jar

出现的错误信息：

Exception in thread "main" java.lang.IllegalStateException: Failed to
get nested archive for entry BOOT-INF/lib/Dependency1.jar
at org.springframework.boot.loader.archive.JarFileArchive.getNestedArchive(JarFileArchive.java:104)
at org.springframework.boot.loader.archive.JarFileArchive$NestedArchiveIterator.adapt(JarFileArchive.java:237)
at org.springframework.boot.loader.archive.JarFileArchive$NestedArchiveIterator.adapt(JarFileArchive.java:228)
at org.springframework.boot.loader.archive.JarFileArchive$AbstractIterator.next(JarFileArchive.java:189)
at org.springframework.boot.loader.ExecutableArchiveLauncher.createClassLoader(ExecutableArchiveLauncher.java:87)
at org.springframework.boot.loader.Launcher.launch(Launcher.java:55)
at org.springframework.boot.loader.JarLauncher.main(JarLauncher.java:88)
Caused by: java.io.IOException: Unable to open nested jar file
'BOOT-INF/lib/Dependency1.jar'
at org.springframework.boot.loader.jar.JarFile.getNestedJarFile(JarFile.java:288)
at org.springframework.boot.loader.jar.JarFile.getNestedJarFile(JarFile.java:274)
at org.springframework.boot.loader.archive.JarFileArchive.getNestedArchive(JarFileArchive.java:100)
... 6 more Caused by: java.lang.IllegalStateException: Unable to open nested entry 'BOOT-INF/lib/Dependency1.jar'. It has been
compressed and nested jar files must be stored without compression.
Please check the mechanism used to create your executable jar file
at org.springframework.boot.loader.jar.JarFile.createJarFileFromFileEntry(JarFile.java:314)
at org.springframework.boot.loader.jar.JarFile.createJarFileFromEntry(JarFile.java:296)
at org.springframework.boot.loader.jar.JarFile.getNestedJarFile(JarFile.java:285)
... 8 more

看起来问题出在压缩上，请问有什么正确操作这类JAR包的方法吗？

错误根源明确：Spring Boot可执行JAR要求嵌套在BOOT-INF/lib下的依赖JAR必须以无压缩（STORED）方式存储，普通jar/zip工具默认用压缩（DEFLATED）模式处理文件，导致加载失败。以下是两种正确操作方式：

方法一：用jar工具指定存储模式添加 #

操作时需通过-0（数字0）参数指定无压缩存储，同时确保依赖JAR路径与JAR内部结构一致（即BOOT-INF/lib）：

1. 先将dependency1.jar和dependency2.jar放到临时创建的BOOT-INF/lib目录中
2. 执行更新命令：

jar -uf0 project.jar BOOT-INF/lib/dependency1.jar BOOT-INF/lib/dependency2.jar

参数说明：

• -u：更新已存在的JAR文件
• -f：指定目标JAR文件名
• -0：仅存储文件，不进行压缩

方法二：解压后重新打包（更稳妥） #

若对路径结构不确定，建议全量解压后操作再重新打包：

1. 解压project.jar到临时目录：

unzip project.jar -d temp_project

2. 将dependency1.jar和dependency2.jar复制到temp_project/BOOT-INF/lib目录下
3. 进入临时目录，用jar命令重新打包（必须带-0参数）：

cd temp_project
jar -cf0 ../new_project.jar .

参数说明：

• -c：创建新的JAR文件
• -f：指定输出JAR文件名
• -0：无压缩存储所有文件
• .：打包当前目录下的全部内容

注意事项 #

• 不要直接将依赖JAR的类文件解压到主JAR的classes目录，这会破坏Spring Boot的类加载逻辑
• 务必保证操作时的路径与JAR内部结构完全匹配（错误信息已明确显示路径为BOOT-INF/lib，而非你描述的根目录lib）

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Holland Park