如何配置R 4.3.3自动创建保存文件所需的子文件夹？

问题描述 #

我有一段用于将图形保存到新子文件夹的R代码：

library(tidyverse)
library(ggplot2)

carb_list = unique(mtcars$carb)

iterate = function(z){
  
df  = mtcars |> filter(carb == z)

df |> 
  ggplot(aes(x=cyl,y=mpg)) + geom_point()

ggsave(filename = paste0("new/carb",z,"/plot.png"))
  
}

sapply(carb_list, iterate)

每次运行这段代码时，控制台都会弹出如下提示，要求确认创建新子文件夹：

Cannot find directory new/carb4.
ℹ Would you like to create a new directory?

此前版本的R会自动创建所需子文件夹，无需手动确认，但升级到最新版本R 4.3.3（Angel Food Cake）后，每次都需要手动确认。希望全局配置R，使其始终自动创建子文件夹，而非逐个文件夹处理。

解决方案 #

方法1：当前会话临时生效 #

在代码开头添加全局选项设置，让当前R会话内的所有ggsave调用自动创建目录：

options(ggplot2.create.dir = TRUE)

方法2：所有会话永久生效 #

修改R的全局配置文件.Rprofile，实现每次启动R时自动启用该选项：

1. 用path.expand("~/.Rprofile")命令查看.Rprofile文件的路径（通常在用户主目录下）
2. 打开该文件，添加以下内容并保存：

options(ggplot2.create.dir = TRUE)

如果不想全局设置，也可以在单个ggsave调用中指定create.dir = TRUE参数，但这种方式需要逐个修改代码，不符合全局配置的需求，因此更推荐上述两种全局设置方案。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者flâneur