容器中用Spack安装LBANN时遇'paths不允许'错误求助

问题根源 #

你遇到的'paths' was unexpected错误，是因为当前使用的Spack版本不支持直接在package条目下使用paths字段，正确的外部包声明需要通过externals数组来配置。

正确的packages.yaml配置示例 #

将你的配置修改为如下结构，替换路径为你实际的OpenMPI安装目录：

packages:
  openmpi:
    externals:
      - spec: openmpi@3.1.6
        prefix: /your/openmpi/install/path  # 比如 /usr/local/openmpi-3.1.6
    buildable: false

配置说明 #

• externals：用于声明系统中已存在的外部软件包，每个条目需要指定两个关键信息：
  • spec：精确匹配你安装的OpenMPI版本（必须和编译时的版本完全一致，包括补丁号）
  • prefix：OpenMPI的安装根目录（该目录下需包含bin、lib、include等子目录）
• buildable: false：强制Spack使用你手动安装的OpenMPI，避免重新编译同名包

验证配置 #

修改后执行以下命令确认配置生效：

spack find openmpi

如果输出中显示openmpi@3.1.6且标注[external]，说明配置正确。

额外注意事项 #

• 确认OpenMPI安装路径在Singularity容器内可正常访问，不存在挂载权限或路径映射问题
• 检查${prefix}/bin/mpicc、${prefix}/lib/libmpi.so等关键文件是否存在，确保手动编译的OpenMPI完整可用

内容的提问来源于stack exchange，提问作者boltz