使用R语言EValue包计算E-value时遇‘x为空’错误求助

问题背景 #

在R 4.3.3环境下使用EValue包（版本4.1.3）计算多变量Cox回归显著变量的E-value时，严格遵循包教程运行测试代码仍触发错误：

Error in var(x, use = "pairwise.complete.obs") : 'x' is empty

目前只能通过在线计算器计算，但效率低下。

测试代码 #

library(EValue)
# compute E-value for HR = 0.56 with CI: [0.46, 0.69]
# for a common outcome
evalue(HR(0.56, rare = FALSE), lo = 0.46, hi = 0.69)
# for a rare outcome
evalue(HR(0.56, rare = TRUE), lo = 0.46, hi = 0.69)

环境信息 #

加载EValue包后的sessionInfo：

R version 4.3.3 (2024-02-29 ucrt)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 11 x64 (build 22621)
...[省略重复内容]

解决建议 #

• 检查并更新依赖包：查看EValue的依赖列表（packageDescription("EValue")$Imports），确保所有依赖包已正确安装且版本与R 4.3.3兼容，必要时更新依赖包。
• 安装开发版EValue：CRAN上的4.1.3版本可能与R 4.3.3存在兼容性问题，尝试安装GitHub上的最新开发版：

  install.packages("devtools")
  devtools::install_github("jenniferthompson/EValue")
  

• 避免函数冲突：确认没有其他包重定义HR或evalue函数，调用时明确指定包名：

  library(EValue)
  EValue::evalue(EValue::HR(0.56, rare = FALSE), lo = 0.46, hi = 0.69)
  

• 清理R环境：重启R，清空工作区（rm(list = ls(all.names = TRUE))），仅加载EValue包后运行测试代码，排除环境中残留变量或函数的干扰。
• 降级R版本：若上述方法无效，可暂时降级至R 4.2.x版本，该版本与EValue 4.1.3的兼容性更稳定。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Mohamed Rahouma