R-4.3.3(Windows)下curl_download下载NCBI FTP文件失败求助

报错原因 #

curl_download的报错是因为C:\Windows目录需要管理员权限才能写入，curl下载时会自动创建临时文件，普通用户权限无法在该目录操作，导致失败。

解决方案 #

1. 更换可写入的目标路径

将下载路径改为用户拥有写入权限的目录（如个人文档、桌面），避免使用系统目录：

library(curl)
url <- "ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/M_musculus/mRNA_Prot/mouse.1.protein.faa.gz"
# 替换为你的桌面路径（需修改用户名）
tmp <- "C:/Users/你的用户名/Desktop/mouse.1.protein.faa.gz"
curl_download(url, tmp)

也可以用R的用户目录简写~，自动指向你的个人文件夹：

tmp <- "~/mouse.1.protein.faa.gz"
curl_download(url, tmp)

2. 使用download.file指定curl方法

既然wininet的FTP功能失效，可直接让download.file调用curl方法（Windows版R-4.3.3通常自带curl）：

url <- "ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/M_musculus/mRNA_Prot/mouse.1.protein.faa.gz"
tmp <- "~/mouse.1.protein.faa.gz"
download.file(url, destfile = tmp, method = "curl", mode = "wb")

注：mode="wb"用于确保二进制压缩文件的正确写入。

3. 手动指定临时文件目录

若坚持使用原目标路径，可通过curl_options指定有权限的临时目录：

library(curl)
url <- "ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/M_musculus/mRNA_Prot/mouse.1.protein.faa.gz"
tmp <- "C:/Windows/Temp.curl"
# 用R默认临时目录（普通用户可写入）
h <- new_handle(tempdir = tempdir())
curl_download(url, tmp, handle = h)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user24533042