R Markdown使用reticulate调用pandas出现ModuleNotFoundError求助

你遇到的矛盾是因为两个完全独立的虚拟环境被混着用了：

• 你通过knitr::opts_chunk$set指定的Python路径是Windows文件系统下的虚拟环境：/mnt/c/Users/steve/workspace/EDGI/EEW-ReportCard-Data/venv/bin/python
• 但virtualenv_create('venv')默认在WSL本地的/home/steve/.virtualenvs/目录创建了另一个虚拟环境，py_install把pandas装到了这个本地环境里

当你执行import('pandas')时，reticulate调用的是你指定的Windows路径下的venv——这个环境里根本没装pandas，所以报错。

两种方案任选其一：

方案一：用你指定的Windows路径下的虚拟环境 #

1. 先清理自动创建的本地冗余venv（可选）：

virtualenv_remove('venv')

2. 修改代码，让virtualenv_create直接指向你原本设置的Windows路径：

knitr::opts_chunk$set(engine.path=list(python='/mnt/c/Users/steve/workspace/EDGI/EEW-ReportCard-Data/venv/bin/python'))
library(reticulate)
# 指定虚拟环境的完整路径，和engine.path对应
virtualenv_create(envname = '/mnt/c/Users/steve/workspace/EDGI/EEW-ReportCard-Data/venv')
py_install('pandas', envname='/mnt/c/Users/steve/workspace/EDGI/EEW-ReportCard-Data/venv')

u <- import('pandas')

方案二：用WSL本地的虚拟环境 #

放弃Windows路径的venv，统一用reticulate默认创建的本地环境：

library(reticulate)
virtualenv_create('venv')
py_install('pandas', envname='venv')
# 显式激活这个本地虚拟环境
use_virtualenv('venv')

u <- import('pandas')

• WSL访问Windows文件系统的虚拟环境可能有权限或兼容性问题，优先推荐用WSL本地的虚拟环境
• 执行py_config()可以查看当前reticulate正在使用的Python环境，方便确认路径是否正确

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user263782