Linux下RStudio默认Java路径查询及永久配置方法（适配sparklyr）

RStudio启动会话时默认的Java路径 #

Linux下RStudio启动时使用的是非登录shell，不会加载/etc/profile这类登录shell的配置文件，它会优先读取系统通过alternatives工具设置的默认Java版本（即你看到的jdk1.7.0_79），如果没有任何环境变量明确指定JAVA_HOME，则Sys.getenv("JAVA_HOME")会返回空值。这就是bash启动R正常但RStudio异常的核心原因。

永久修改RStudio中的Java路径方案 #

1. 全局生效（所有RStudio用户） #

编辑RStudio服务器的配置文件/etc/rstudio/rserver.conf（不存在则创建），添加：

rsession-env-vars=JAVA_HOME=/usr/local/java/jdk1.8.0_131

保存后重启RStudio服务：

sudo systemctl restart rstudio-server

2. 当前用户生效 #

在用户主目录下创建或编辑.Rprofile文件，添加：

if (Sys.getenv("JAVA_HOME") == "") {
  Sys.setenv(JAVA_HOME = "/usr/local/java/jdk1.8.0_131")
}

每次RStudio启动新会话时，会自动执行该脚本中的配置。

3. 系统级非登录shell配置 #

编辑/etc/environment（所有进程都会读取的系统环境变量文件），添加：

JAVA_HOME="/usr/local/java/jdk1.8.0_131"

保存后无需重启，下次RStudio启动会话即可生效。

或者编辑/etc/bash.bashrc，添加：

export JAVA_HOME=/usr/local/java/jdk1.8.0_131
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH

该配置对所有bash非登录shell生效，包括RStudio。

4. 调整系统默认Java版本（可选） #

若希望整个系统默认Java切换为jdk1.8.0_131，可通过alternatives命令设置：

# 注册Java和Javac的备选版本
sudo alternatives --install /usr/bin/java java /usr/local/java/jdk1.8.0_131/bin/java 100
sudo alternatives --install /usr/bin/javac javac /usr/local/java/jdk1.8.0_131/bin/javac 100

# 选择默认版本
sudo alternatives --config java
sudo alternatives --config javac

在弹出的选项中选择对应jdk1.8.0_131的序号即可。注意此操作会影响整个系统的Java默认版本，需确认其他服务不受影响。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者cloudscomputes