升级Intel Conda版Numpy 1.24.3后遇大量RuntimeWarning求助

这并非Numpy不再支持NaN，而是Intel Conda频道提供的Numpy 1.24.3版本与Pandas 2.2.1搭配时存在的兼容性bug。

问题原因 #

当数据中包含NaN时，Pandas内部调用的Numpy核心例程（如Expressions.py中的逻辑）直接使用<、>运算符与NaN进行比较。根据浮点标准，NaN与任何值的比较都会返回False，同时触发RuntimeWarning——并非NaN本身不被支持，而是该版本的Numpy未在内部处理这类比较的警告抑制。

解决方案 #

1. 升级Numpy版本（推荐） #

升级到Numpy 1.24.6及以上版本即可修复该问题，执行以下conda命令：

conda install -c intel numpy>=1.24.6

2. 临时屏蔽警告（仅应急使用） #

如果暂时无法升级版本，可以通过代码临时屏蔽这类RuntimeWarning：

import warnings
warnings.filterwarnings("ignore", category=RuntimeWarning)

注意：此方法仅隐藏警告，未修复底层问题，不适合长期使用。

复现步骤 #

按以下操作可复现该问题：

1. 更新conda：

conda update conda

2. 创建并激活测试环境：

conda create -n "test_numpy" python=3.10
conda activate test_numpy

3. 安装指定版本依赖：

conda install -c intel numpy==1.24.3 pandas=2.2.1

4. 执行测试代码：

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(index=[0, 1, 2, 3])
df["A"] = [0., 1., np.NaN, 2.]
print(df)

此时会触发多条RuntimeWarning。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Tunneller