Condor作业运行触发Shadow异常Assertion ERROR问题求助

错误表现 #

执行Condor作业时反复触发以下错误：

007 (1240.000.000) 2024-06-19 16:32:47 Shadow exception!
Assertion ERROR on (result)
0 - Run Bytes Sent By Job
0 - Run Bytes Received By Job

已尝试的无效操作 #

• 修改相关文件权限，未解决Shadow异常
• 将脚本中eval \scramv1 runtime -sh``移至第6行，因作业未进入scram环境区域执行报错
• 调整提交脚本shebang、为AK4_improved.py添加shebang，尝试多种首行配置组合，问题仍存在

提交脚本内容 #

#!/bin/bash
export VO_CMS_SW_DIR=/cvmfs/cms.cern.ch
source $VO_CMS_SW_DIR/cmsset_default.sh
export CMSSW_GIT_REFERENCE=/cvmfs/cms.cern.ch/cmssw.git
export HOME=/home/ajl357/
cd $GEN_DIR_BASE
cd /cms/***/src
eval `scramv1 runtime -sh`
cmsenv
cd /cms/***/test
cmsRun AK4_improved.py inputTextFile='BG.txt' fileNum= $1

针对性排查与修复建议 #

1. 路径与环境变量校验

   • 检查$GEN_DIR_BASE是否在Condor执行环境中正确定义，若未定义会导致cd命令失败，中断后续环境初始化流程
   • 确认/cms/***/src和/cms/***/test在执行节点上存在且Condor执行用户拥有读/执行权限

2. scram环境初始化优化

   • cmsenv是eval \scramv1 runtime -sh``的封装，两者重复执行可能引发环境变量冲突，建议保留其中一个即可
   • 必须确保进入CMSSW的src目录后再执行scram初始化命令，避免路径不匹配导致环境加载失败

3. 命令参数修正

   • fileNum= $1存在空格，会被解析为两个独立参数，应改为fileNum=$1，避免cmsRun参数解析异常

4. Condor作业配置检查

   • 确认提交文件中environment参数已正确传递必要环境变量到执行节点
   • 检查initialdir设置是否合理，避免作业依赖本地路径导致执行异常

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Aidan Lawlor