DataFrame含3105列仅2个唯一列名，如何按列名分组求行均值？

直接用Pandas的groupby按列名分组，配合mean()就能搞定，步骤如下：

1. 先把Gene列设为行索引（避免计算时把Gene列也纳入分组）：

df = df.set_index('Gene')

2. 按列名分组计算每行均值：
   指定按列方向（axis=1）分组，用列名作为分组依据，然后对每组求行均值：

result_df = df.groupby(df.columns, axis=1).mean()

3. （可选）把Gene转回普通列：
   如果需要Gene作为列而不是索引，执行重置索引操作：

result_df = result_df.reset_index()

这样得到的result_df就只有Gene（可选）、Cell_A、Cell_B三列，每一行对应单个基因在两类细胞中的均值。

补充说明 #

• groupby(df.columns, axis=1)会自动把所有同名列（比如所有Cell_A列）归为一组
• mean()默认按行维度计算，正好对应每个基因在同组列中的平均值
• 如果你的Gene列已经是DataFrame的索引，可以直接跳过第一步

内容的提问来源于stack exchange，提问作者careless_caramel