生成混合效应模型遇cholmod_factor_ldetA错误，Matrix包无法安装求助

运行混合效应模型时触发错误：

Error in initializePtr(): function 'cholmod_factor_ldetA' not provided by package Matrix

尝试卸载重装Matrix和lme4包后问题恶化，当前无法安装这两个包，系统提示：

Matrix package not available for this version of R

已尝试的操作：

• 执行以下命令尝试源码安装lme4：

  tools::package_dependencies("Matrix", which = "LinkingTo", reverse = TRUE)
  utils::install.packages("lme4", type = "source")
  

  仍提示无法打开仓库错误。
• 指定CRAN源安装：

  oo <- options(repos = "https://cran.r-project.org/")
  utils::install.packages("Matrix")
  utils::install.packages("lme4")
  options(oo)
  

  得到报错：

  Warning messages:
  1: In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
    there is no package called ‘Matrix’
  2: In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
    there is no package called ‘Matrix’
  Warning: unable to access index for repository https://cran.r-project.org/bin/macosx/big-sur-arm64/contrib/4.2:
    download from 'https://cran.r-project.org/bin/macosx/big-sur-arm64/contrib/4.2/PACKAGES' failed
  Warning message:
  package ‘Matrix’ is not available for this version of R
  
  A version of this package for your version of R might be available elsewhere,
  see the ideas at
  https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages 
  

• 尝试多种卸载重装命令：

  remove.packages("Matrix")
  install.packages("Matrix")
  library(matrix)
  
  remove.packages("Matrix")
  remove.packages("lme4")
  install.packages("lme4", type = "source")
  library(lme4)
  

  均因无法安装Matrix包失败。

1. 优先升级R版本（最简便） #

从报错信息看，当前使用的是R 4.2 + macOS Big Sur ARM64，该环境下CRAN已停止提供对应版本的Matrix二进制包。升级到R 4.3.x及以上稳定版：

• 卸载当前R，前往官方渠道下载最新版本安装
• 打开新R环境，直接执行：

  install.packages(c("Matrix", "lme4"))
  library(lme4)
  

  新版本R会自动匹配兼容的Matrix二进制包，无需额外操作。

2. 源码安装Matrix（保留R 4.2时使用） #

若必须保留当前R版本，需先安装编译依赖：

• macOS用户：
  1. 安装Xcode命令行工具：

     xcode-select --install
     

  2. 通过Homebrew安装gcc（提供编译所需的gfortran）：

     brew install gcc
     

  3. 在R中执行源码安装：

     install.packages("Matrix", type = "source")
     install.packages("lme4", type = "source")
     

3. 手动安装兼容旧版本Matrix #

找到与R 4.2兼容的Matrix旧版本（如1.5-3）：

1. 下载对应版本的.tar.gz源码包
2. 在R中执行本地安装：

   install.packages("~/Downloads/Matrix_1.5-3.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
   

   替换路径为你实际的下载文件路径，完成后再安装lme4。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ramanpreet Kaur