fread读取全NA列指定为POSIXct类型遇警告并转为字符列问题

问题详情 #

我尝试用data.table的fread()读取一列全为NA的POSIXct类型数据，代码如下：

library(data.table)
fwrite(data.table(datetime = as.POSIXct(NA)), "test.csv")
fread("test.csv", colClasses = "POSIXct")

但运行后触发警告，列被保留为字符型而非POSIXct：

Warning message:
Column 'datetime' was requested to be 'POSIXct' but fread encountered the following error:
character string is not in a standard unambiguous format
so the column has been left as type 'character'

而使用base包的write.csv()+read.csv()组合可以正常实现需求：

write.csv(data.frame(datetime = as.POSIXct(NA)), "test.csv", row.names = FALSE)
read.csv("test.csv", colClasses = "POSIXct")

当前使用data.table版本为1.15.4，已就此问题提交官方Issue。

可行解决方法 #

方法1：读取后手动转换 #

先让fread()按默认方式读取列，之后手动将其转为POSIXct类型。由于列中全为NA，转换不会遇到格式问题：

dt <- fread("test.csv")
dt[, datetime := as.POSIXct(datetime)]

方法2：通过colClasses指定转换逻辑 #

利用fread()的colClasses参数，直接传入转换规则。用列表形式指定目标列的转换类型：

fread("test.csv", colClasses = list(POSIXct = "datetime"))

该方式会直接将指定列转为POSIXct类型，无需后续手动处理。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Markus