如何用data.table按ID分组批量计算多列均值(免逐个定义)
解决data.table多列分组求均值的高效方法
直接用.SD配合lapply就能搞定,不用手动列每一列,也不用循环,这是data.table原生的高效写法:
- 如果你明确知道要处理的列是v1到v99,直接指定列名范围:
dt[, lapply(.SD, mean), by = ID, .SDcols = paste0("v", 1:99)] - 如果目标列都是以
v开头的(比如后续新增v100也自动包含),用正则匹配更灵活:dt[, lapply(.SD, mean), by = ID, .SDcols = patterns("^v")] - 如果除了ID列之外全是要计算的列,也可以直接排除ID列:
dt[, lapply(.SD, mean), by = ID, .SDcols = !"ID"]
原理很简单:.SD代表分组后的数据子集,.SDcols用来指定要处理的列,lapply(.SD, mean)就是对每个子集里的指定列逐个计算均值,全程是data.table的底层优化,比循环快得多。
之前用.SD出错大概率是没指定.SDcols,或者没把.SD放到lapply里——单独用.SD只会返回子集数据,不会做聚合计算。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者neuropsych
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