将Rmarkdown编织为PDF时出现grid.Call.graphics错误求助

问题本质 #

这个错误是因为PDF渲染设备无法识别绘图中使用的字符集，尤其是当节点标签包含非ASCII字符（如中文、特殊符号）时，ggplot2/ggraph默认字体在PDF设备下的字符集支持不足。而HTML或普通R环境的绘图设备对字符兼容性更强，所以不会触发错误。

具体解决方法 #

• 更换PDF渲染设备
  在Rmarkdown的YAML头部指定cairo_pdf设备，它对多字符集的支持更完善：

  output:
    pdf_document:
      dev: cairo_pdf
  

  或者在单个代码块中指定设备：

  ```{r, dev='cairo_pdf'}
  # 你的绘图代码
  

• 显式指定支持目标字符的字体
  根据操作系统选择对应字体，比如Windows用"SimHei"，Mac用"PingFang SC"，Linux用"Noto Sans CJK SC"，修改绘图代码中的文本元素：

  tidyclassroom %>%
    activate("nodes") %>%
    ggraph(layout=comparison) +
    geom_edge_link(
      end_cap = circle(12, "pt"),
      color = "grey", 
      arrow = arrow(length=unit(5, "pt"))) +
    geom_node_point(size=10, shape=21, fill=ifelse(V(graph)$sex == 2, "pink", "lightblue")) +
    geom_node_text(aes(label = name), colour = 'black', vjust = 0.4, family = "SimHei") +
    ggtitle('August 2023') +
    theme_graph() +
    theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5, family = "SimHei"))
  

• 统一字符编码
  强制将节点标签的编码设为UTF-8，避免编码混乱：

  Encoding(V(graph)$name) <- "UTF-8"
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者sunny