Snakemake中Checkpoints与WorkflowError:缺失通配符值问题求助
Snakemake Checkpoint处理空文件时的"Missing wildcard"错误问题
- 在工作流的特定checkpoint后,我使用
get_txt_files和not_empty_files函数生成通配符值列表 - 第一个checkpoint用于捕获某规则生成的初始未知文件名对应的通配符值
- 由于后续某规则可能生成空输出文件,我设置了第二个checkpoint,意图更新通配符值并排除空文件以进行后续处理,但目前遇到了**"Missing wildcard"**错误
- 已准备好简化的复现代码
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Anna
相关产品推荐
相关产品推荐

