无法加载ggm包：提示缺失graph包，反复重装仍未解决

问题原因 #

ggm包依赖于graph包，但graph不属于CRAN仓库，而是Bioconductor仓库的包。直接通过CRAN安装ggm时，无法自动获取并安装这个跨仓库的依赖，因此导致加载报错。

解决步骤 #

• 先安装Bioconductor的包管理工具（未安装过的话执行）：

  if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))
      install.packages("BiocManager")
  

• 通过BiocManager安装graph依赖包：

  BiocManager::install("graph")
  

• 重新安装并加载ggm包：

  install.packages("ggm")
  library(ggm)
  

额外注意事项 #

• 若安装graph时遇到权限问题：Windows系统可右键以管理员身份运行R；Linux/macOS系统如果是系统级R安装，可在安装命令前添加sudo。
• 确保你的R版本满足graph包的要求，若R版本过低，需先升级R后再执行上述步骤。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者john klei