RStudio读取TSV文件异常：第二列含空格导致行拆分错误

方案1：使用readr包的read_tsv（推荐） #

readr包的读取函数对不规则换行的鲁棒性更强，能自动识别因内容含空格而被错误拆分的行：

# 安装并加载readr包
install.packages("readr")
library(readr)

# 读取TSV文件
neuro_subclusters <- read_tsv("https://shendure-web.gs.washington.edu/content/members/DEAP_website/public/RNA/update/neuronal_fine_scale_annotations/neuronal_subcluster_annotations.txt")

方案2：基础R的read.table设置参数 #

通过指定分隔符、填充缺失列等参数，强制按列数解析文件：

neuro_subclusters <- read.table(
  url("https://shendure-web.gs.washington.edu/content/members/DEAP_website/public/RNA/update/neuronal_fine_scale_annotations/neuronal_subcluster_annotations.txt"),
  sep = "\t",          # 指定制表符为分隔符
  header = TRUE,       # 第一行作为列名
  fill = TRUE,         # 自动填充缺失列，处理错误换行
  quote = ""           # 禁用引号解析，避免干扰空格内容
)

问题说明 #

原代码用read.delim时，文件中第二列的双词内容被错误拆分为新行，导致read.delim将这些拆分后的行当作新的观测，引发列数不匹配的解析错误。而上述两种方法会根据文件的列数结构，自动合并被错误拆分的行，完成正确解析。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user27185819