git merge-file处理外部文件后，git checkout --ours/--theirs不符合预期的问题

原因分析 #

git checkout --ours/theirs的生效前提是文件处于Git的未合并状态——此时暂存区会同时存储该文件的三个版本：当前分支版本（ours）、基准版本（base）、对方版本（theirs）。

但你当前的情况是：

1. git merge-file只是直接修改了工作区的README.md，写入了冲突标记，但没有通知Git将该文件标记为未合并状态。git ls-files -s显示文件处于正常跟踪状态，说明暂存区里只有当前分支的版本。
2. 合并使用的/tmp下的文件是仓库外部资源，Git没有将这些文件的内容存入自身的对象库，因此暂存区里根本没有"theirs"对应的版本数据。执行git checkout --theirs时，Git找不到对应的blob对象，只能 fallback 到当前已有的版本。

解决方法 #

方法1：让Git识别文件为未合并状态（推荐） #

通过手动将三个版本存入Git对象库，并标记文件为未合并状态，这样checkout --ours/theirs就能正常工作：

1. 生成三个版本的blob哈希（将文件内容存入Git对象库）：

   # 当前工作区版本（before updating）作为ours
   OURS_HASH=$(git hash-object -w README.md)
   # 模板旧版本（last update）作为基准base
   BASE_HASH=$(git hash-object -w /tmp/project_generated_from_previous_template_version/README.md)
   # 模板新版本（after updating）作为theirs
   THEIRS_HASH=$(git hash-object -w /tmp/project_generated_from_latest_template_version/README.md)
   

2. 更新暂存区，将文件设置为未合并状态：

   git update-index --index-info <<EOF
   100644 $OURS_HASH 1 README.md
   100644 $BASE_HASH 2 README.md
   100644 $THEIRS_HASH 3 README.md
   EOF
   

3. 此时执行git checkout --ours README.md或git checkout --theirs README.md就能得到预期结果，解决冲突后用git add README.md标记完成即可。

方法2：直接替换文件内容（快速解决） #

如果不需要Git维护合并状态，直接用目标版本覆盖工作区文件：

• 要获取"after updating"的内容，直接复制模板文件：

  cp /tmp/project_generated_from_latest_template_version/README.md README.md
  

• 之后执行git add README.md提交修改即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者pawamoy