你的需求完全可行，但要分清Pandoc两个核心参数的作用，别搞混用法，下面是具体解决方法：

一、先明确--reference-doc和--template的本质区别 #

• --reference-doc：仅用于继承Word文档的格式体系（样式、页眉页脚、页面布局、封面样式），不会识别和替换模板里的占位符，它的作用是把你的Markdown内容套用到这个文档的格式框架里。
• --template：仅支持纯文本格式的模板（如LaTeX、HTML、Markdown模板），不能直接处理docx/dotx这类二进制/XML结构的Word文件——这就是你用它时出现编码错误的原因：Pandoc把Word文件当成了纯文本模板读取，自然会出现乱码报错。

二、解决--reference-doc输出空白的问题 #

输出空白大概率是输入内容缺失或模板本身有问题：

1. 确保你的输入Markdown文件有实际内容，且带YAML元数据（用于传递标题、作者等变量）：

   ---
   title: "项目总结报告"
   author: "Mark Pinsley"
   ---
   
   # 一、项目核心进展
   这是文档的正文内容，会自动套用模板的样式规范。
   

2. 执行生成命令：

   pandoc input.md --reference-doc=你的模板文件.docx -o output.docx
   

3. 如果还是空白，换一个干净的测试模板：新建空白Word文档，手动设置好封面、正文样式，直接保存为docx再试，避免原dotx文件可能存在的格式损坏或宏干扰。

三、实现封面动态插入标题、作者变量 #

推荐两种可靠方案：

方案1：Word域 + --reference-doc（最简单易维护） #

1. 打开你的Word模板，在封面需要插入变量的位置操作：
   • 点击「插入」→「文档部件」→「域」
   • 类别选「链接和引用」，域名选「Title」，确定后插入标题域；作者同理插入「Author」域
2. 保存模板为docx格式，再用--reference-doc命令生成文档：Pandoc会自动把Markdown YAML里的title、author值填充到对应的Word域中，同时正文自动套用模板的格式。

方案2：Lua过滤器替换自定义占位符（更灵活） #

如果不想用Word域，可在模板里写自定义占位符（比如{{文档标题}}、{{作者名称}}），再通过Lua过滤器替换：

1. 编写过滤器文件replace-vars.lua：

   function Para (elem)
     for i, run in pairs(elem.content) do
       if run.text == "{{文档标题}}" then
         run.text = pandoc.utils.stringify(PANDOC_META["title"])
       elseif run.text == "{{作者名称}}" then
         run.text = pandoc.utils.stringify(PANDOC_META["author"])
       end
     end
     return elem
   end
   

2. 执行生成命令：

   pandoc input.md --reference-doc=带自定义占位符的模板.docx --lua-filter=replace-vars.lua -o output.docx
   

总结 #

• 绝对不要用--template参数处理Word文件，它不支持二进制格式的模板；
• 用--reference-doc继承格式，搭配Word域或Lua过滤器实现动态变量填充，完全能满足你生成带封面、可动态替换变量的Word文档需求。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Mark Pinsley