你当前的删除脚本仅销毁了生成克隆体的源零件cloner，但克隆体是独立于源零件的实例，因此无法被连带删除。要清除所有克隆体，需要主动定位并销毁这些实例，以下是两种可行方案：

方案一：给克隆体添加标记批量删除 #

修改克隆零件的脚本（零件内的普通脚本） #

给每个克隆体设置统一的名称或属性，方便后续识别：

while true do
    wait()
    local clonepart = script.Parent:Clone()
    clonepart.Parent = game.Workspace
    clonepart.Anchored = false
    -- 给克隆体设置专属名称作为标记
    clonepart.Name = "TestClonePart"
end

修改删除功能的本地脚本（GUI按钮内） #

遍历工作区，找到所有带标记的克隆体并销毁：

script.Parent.MouseButton1Up:Connect(function()
    -- 遍历工作区所有子对象
    for _, part in ipairs(game.Workspace:GetChildren()) do
        -- 判断是否为目标克隆体
        if part.Name == "TestClonePart" then
            part:Destroy()
        end
    end
    -- 如需同时销毁源零件，取消下方注释
    -- game.Workspace.cloner:Destroy()
end)

方案二：用容器统一管理克隆体（更高效） #

先在Workspace中创建一个Folder并命名为CloneContainer，将所有克隆体放入该容器，后续直接清空容器即可。

修改克隆零件的脚本 #

local cloneContainer = game.Workspace.CloneContainer

while true do
    wait()
    local clonepart = script.Parent:Clone()
    clonepart.Parent = cloneContainer
    clonepart.Anchored = false
end

修改删除功能的本地脚本 #

local cloneContainer = game.Workspace.CloneContainer

script.Parent.MouseButton1Up:Connect(function()
    -- 清空容器内所有克隆体
    for _, part in ipairs(cloneContainer:GetChildren()) do
        part:Destroy()
    end
    -- 如需同时销毁源零件，取消下方注释
    -- game.Workspace.cloner:Destroy()
end)

方案二更适合大量克隆体的场景，无需遍历整个工作区，执行效率更高。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者aadidev g