Dockerfile中CMake无法识别Conda安装的libboost及环境变量异常

我使用以下精简版Dockerfile构建应用：

FROM pangeo/pangeo-notebook:2024.04.08 AS base
USER root
# 安装依赖
RUN apt-get update && apt-get install -y vim gfortran sqlite3 libsqlite3-dev ...
RUN mamba install -c conda-forge libboost -y #<--------------------------- libboost 安装

FROM base AS prebuild
...

FROM prebuild AS app_clone
WORKDIR /app
RUN git clone ...

FROM app_clone AS app_build
ENV PATH=${PATH}:/usr/bin/mpich
ENV PATH=/usr/bin:${PATH} #<-------------- 环境变量未在镜像中生效
ENV CC=/usr/bin/gcc #<------------- 环境变量未在镜像中生效
WORKDIR /app

RUN cmake -G Ninja -B cmake_build_serial -S . && \
    cmake --build cmake_build_serial --target all -- -j $(nproc)

由于需要至少1.79.0版本的libboost，我通过mamba安装。但遇到两个问题：

• 执行docker build --no-cache --platform linux/amd64 -t test-app .构建时，CMake提示无法找到Boost；但注释最后一行cmake命令后，启动容器手动执行该编译命令却能正常完成。
• 进入容器后，设置的CC环境变量未指向指定路径，PATH也未以/usr/bin作为前缀。

解决方案 #

修改Dockerfile，在执行cmake命令前，设置SHELL让后续RUN命令自动激活notebook环境：

# 让RUN命令使用notebook环境
SHELL ["mamba", "run", "--no-capture-output", "-n", "notebook", "/bin/bash", "-c"]
RUN cmake -G Ninja -B cmake_build_serial -S . && \
    cmake --build cmake_build_serial --target all -- -j $(nproc)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者F Baig