你的脚本存在两个关键问题，导致排除规则无法生效：

1. SynchronizeDirectories参数顺序错误 #

你调用该方法时，将transferOptions放在了mirror参数的位置，导致传输选项没有被正确加载。正确的参数顺序为：

• 同步模式
• 本地路径
• 远程路径
• 是否删除远程多余文件（removeFiles）
• 是否启用镜像模式（mirror，可选，默认false）
• 传输选项（transferOptions，可选）

修正后的调用代码：

$synchronizationResult = $session.SynchronizeDirectories(
    [WinSCP.SynchronizationMode]::Remote, 
    $localPath, 
    $remotePath, 
    $True,
    $False, # 根据需求设置是否启用镜像
    $transferOptions
)

2. FileMask排除格式错误 #

WinSCP的文件掩码中，排除文件夹需要明确标记为目录（以路径分隔符结尾），否则会误匹配同名文件。要排除System Volume Information文件夹及其所有内容，正确的掩码格式是：

$transferOptions.FileMask = "| System Volume Information/"

如果需要排除多个系统文件夹，用分号分隔即可：

$transferOptions.FileMask = "| System Volume Information/; $RECYCLE.BIN/"

完整修正后的脚本 #

param (
    $localPath = "E:\path",
    $remotePath = "/disk_files_backup/disk_E",
)

try {
    Add-Type -Path "C:\Program Files (x86)\WinSCP\WinSCPnet.dll"

    $sessionOptions = New-Object WinSCP.SessionOptions -Property @{
        Protocol = [WinSCP.Protocol]::Sftp
        HostName = "*"
        UserName = "*"
        Password = "*"
        GiveUpSecurityAndAcceptAnySshHostKey = $True
    }

    $session = New-Object WinSCP.Session

    try {
        # 连接服务器
        $session.Open($sessionOptions)

        # 设置传输选项
        $transferOptions = New-Object WinSCP.TransferOptions
        $transferOptions.TransferMode = [WinSCP.TransferMode]::Binary
        # 排除指定系统文件夹
        $transferOptions.FileMask = "| System Volume Information/" 
 
        # 同步目录并获取结果
        $synchronizationResult = $session.SynchronizeDirectories(
            [WinSCP.SynchronizationMode]::Remote, 
            $localPath, 
            $remotePath, 
            $True,
            $False,
            $transferOptions
        )
        $synchronizationResult.Check() # 检查同步过程中的错误
    }
    finally {
        # 关闭会话
        $session.Dispose()
    }
    exit 0
}
catch {
    Write-Host "Error: $($_.Exception.Message)"
    exit 1
}

额外建议：添加$synchronizationResult.Check()可以主动抛出同步过程中的错误，便于排查问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者my min_d